284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0439 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
229 aa  473  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.72 
 
 
229 aa  307  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64.04 
 
 
228 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  61.3 
 
 
231 aa  301  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  61.3 
 
 
231 aa  301  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  63.16 
 
 
228 aa  301  6.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.96 
 
 
228 aa  300  9e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.05 
 
 
253 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  54.87 
 
 
233 aa  272  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  54.42 
 
 
233 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  57.92 
 
 
237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  58.82 
 
 
237 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  57.92 
 
 
237 aa  260  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  57.47 
 
 
237 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.58 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.58 
 
 
233 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.82 
 
 
233 aa  248  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.23 
 
 
232 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  52.63 
 
 
258 aa  239  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  46.64 
 
 
235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.87 
 
 
232 aa  155  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.23 
 
 
231 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.63 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.22 
 
 
232 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.84 
 
 
237 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36 
 
 
237 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.5 
 
 
232 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.56 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.29 
 
 
226 aa  134  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.18 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.06 
 
 
233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35 
 
 
233 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.55 
 
 
233 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.55 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.28 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.88 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.58 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.74 
 
 
227 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.97 
 
 
243 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.52 
 
 
233 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.18 
 
 
233 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.17 
 
 
244 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.6 
 
 
243 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.97 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.97 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.56 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.56 
 
 
222 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0141  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.27 
 
 
247 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2743  methyltransferase type 12  32.79 
 
 
290 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.99 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.99 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  28.78 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  31.13 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.87 
 
 
308 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  34 
 
 
236 aa  52  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  35.11 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.01 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.33 
 
 
434 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.3 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  30 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2675  hypothetical protein  28.7 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  25.64 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.08 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  36 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  28.98 
 
 
491 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1959  methyltransferase type 12  24.06 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.97 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.91 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1047  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.85 
 
 
403 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350309  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  32.69 
 
 
263 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.17 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.91 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0094  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.87 
 
 
439 aa  49.3  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.146255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  29.03 
 
 
458 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  26.44 
 
 
254 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  31.97 
 
 
285 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.71 
 
 
247 aa  48.5  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  29.51 
 
 
460 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  29.51 
 
 
458 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  29.51 
 
 
458 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  29.51 
 
 
458 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  36.78 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  29.51 
 
 
458 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  39.39 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.85 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  33.04 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  36.78 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.44 
 
 
442 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.83 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.98 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>