More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1907 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
237 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  79.31 
 
 
237 aa  374  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  59.13 
 
 
226 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  46.52 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  47.14 
 
 
232 aa  226  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  44.35 
 
 
231 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  46.09 
 
 
232 aa  222  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  43.78 
 
 
233 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  44.49 
 
 
232 aa  217  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  43.35 
 
 
233 aa  210  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.3 
 
 
232 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.51 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.27 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.86 
 
 
233 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.03 
 
 
232 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.48 
 
 
237 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.13 
 
 
237 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.11 
 
 
233 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.61 
 
 
233 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.61 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.19 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  34.05 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.04 
 
 
228 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.56 
 
 
231 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36 
 
 
229 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.56 
 
 
231 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  32.77 
 
 
258 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.48 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.34 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.15 
 
 
233 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.61 
 
 
233 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.15 
 
 
236 aa  131  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  33.33 
 
 
235 aa  129  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.84 
 
 
243 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.91 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.6 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.47 
 
 
233 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.05 
 
 
233 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.72 
 
 
243 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.71 
 
 
244 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.16 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.35 
 
 
222 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.05 
 
 
233 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.44 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.48 
 
 
222 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.62 
 
 
229 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.48 
 
 
222 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.76 
 
 
227 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  46.67 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.27 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.71 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.74 
 
 
238 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.67 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.04 
 
 
237 aa  55.1  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.02 
 
 
232 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.99 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
246 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.82 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.62 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.5 
 
 
420 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.44 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.99 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.18 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  43 
 
 
258 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.96 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
252 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.31 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  47.44 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.25 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
211 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.75 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.57 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  32.56 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  36.79 
 
 
223 aa  51.6  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  37.29 
 
 
414 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.7 
 
 
424 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2254  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.72 
 
 
417 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249887  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.96 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.59 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.88 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.2 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  43.01 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.93 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.96 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.1 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.79 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  32 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.98 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.67 
 
 
251 aa  49.7  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  31.01 
 
 
190 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.63 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 
226 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.93 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>