More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3368 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  100 
 
 
190 aa  377  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  92.11 
 
 
190 aa  351  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  55.32 
 
 
189 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  45.74 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  48.4 
 
 
196 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  40.12 
 
 
182 aa  104  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  40 
 
 
183 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  36.59 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  42.03 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  35.62 
 
 
181 aa  89  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  40.6 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.92 
 
 
266 aa  85.5  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  41.35 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  46.39 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  36.65 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  33.16 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  39.16 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  36.23 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  38.55 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  38.06 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  36.09 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  41.18 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  38.89 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  30.18 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  36.09 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  34.33 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  37.31 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  31.29 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  36.03 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  32.09 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  36.87 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  32.09 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  32.79 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  33.95 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  31.34 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  37.04 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  32.79 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  35.71 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  31.34 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  34.81 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  34.35 
 
 
149 aa  72  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  38.6 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  34.33 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  32.84 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  35.07 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  35.51 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  34.48 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  36.57 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  38.64 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  32.43 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  33.09 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  32.1 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  32.19 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  35.07 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  28 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  28.99 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  24.29 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  28.28 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  33.86 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  34.46 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  29.7 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  31.11 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  29.5 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  31.11 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  32.93 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  31.11 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  40.45 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  32.7 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  29.53 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  31.11 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  34.75 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  30.23 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  39.06 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  30.23 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  30.23 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  30.23 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  31.16 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  35.07 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  34.29 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  33.65 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  33.82 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>