285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1067 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  72.63 
 
 		 191 aa  261  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  60.11 
 
 		 200 aa  221  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  60.64 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  60.64 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  59.57 
 
 		 200 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  61.54 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  61.76 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  60.44 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  60.99 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  58.24 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  56.84 
 
 		 205 aa  204  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  58.01 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  58.01 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  58.01 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  58.01 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  58.01 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  58.01 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  57.45 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  58.01 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  56.91 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  57.22 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  55.61 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  63.91 
 
 		 195 aa  187  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  55.73 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  53.81 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  52.97 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  53.93 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  57.67 
 
 		 212 aa  175  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  57.54 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  54.65 
 
 		 190 aa  174  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  54.07 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  57.75 
 
 		 195 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  55.29 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  53.33 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  54.49 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  57.23 
 
 		 195 aa  164  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  50.93 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  45.52 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  40.85 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  40.85 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  41.55 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  34.16 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  40.41 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  37.72 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  40.41 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  40.77 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  39.73 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  41.03 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  42.94 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  37.5 
 
 		 177 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  35.26 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  36.9 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  35.71 
 
 		 184 aa  95.1  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  35.96 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  43.14 
 
 		 168 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  36.49 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  37.2 
 
 		 189 aa  84.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  38.93 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  39.16 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  41.22 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  37.35 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  36.43 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.9 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  36.71 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  36.71 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  35.33 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  36.84 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  35.2 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  37.32 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  35.67 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  26.38 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  38.1 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  36.99 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  32.72 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13140  hypothetical protein  32.12 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.225832 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  30.43 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  30.43 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  30.43 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  24.65 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  32.14 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  35.07 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29824  predicted protein  29.34 
 
 		 358 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 270 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  36.7 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  24.65 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  30 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  32.65 
 
 		 286 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  32 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  32.12 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  23.78 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  23.78 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  32.12 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  36.73 
 
 		 410 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>