248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0754 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  58.88 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  57.36 
 
 		 213 aa  207  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  54.87 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  53.73 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  49.49 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  47.21 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  51.26 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  44.67 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  40.7 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  43.88 
 
 		 217 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  43.88 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  40.7 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  40.61 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  37.56 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  37.06 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  39.9 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  37.76 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  39.8 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  34.69 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  40.31 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  32.31 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  31.12 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  31.12 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  30.96 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  31.79 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  30.85 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  30.35 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  29.5 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 149 aa  89  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  28.22 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  34.46 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  35.34 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  35.56 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  32.34 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  35.17 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0410  hypothetical protein  58.06 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.11 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  34.33 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  35.34 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  29.88 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  23.74 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  30.41 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.89 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  34.97 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  29.08 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.01 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  33.03 
 
 		 261 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.03 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  33.03 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  33.03 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  33.03 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  33.03 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  33.03 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  33.03 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  33.04 
 
 		 283 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.55 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  36.09 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 544 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  30.12 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  31.63 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 348 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  33.53 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 290 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 267 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  32.98 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  34.58 
 
 		 267 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 275 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 275 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  34.58 
 
 		 267 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  34.58 
 
 		 267 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>