More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4194 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5451  methyltransferase type 11  53.27 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  47.94 
 
 		 195 aa  185  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  43.81 
 
 		 196 aa  174  9e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  46.11 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  44.95 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  41.85 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  41.85 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  42.22 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  42.46 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  43.04 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  41.97 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  36.17 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  40 
 
 		 241 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12690  hypothetical protein  36.36 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.09325e-49  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1324  methyltransferase type 11  38.55 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1461  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5471  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  0.745032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5245  methyltransferase type 12  34.73 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4877  methyltransferase type 12  34.73 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4966  methyltransferase type 12  34.73 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  33.76 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  33.76 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  33.76 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  33.76 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  33.76 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  33.76 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  32.28 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  36.55 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  30.69 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.735974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  27.16 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  29.38 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 277 aa  68.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3997  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3396  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3294  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.216078  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.29 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  34.81 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.33 
 
 		 541 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  32.35 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  32.35 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  32.35 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  32.35 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.82 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.65 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  30.05 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  26.32 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  33.96 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  33.96 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.66 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  26.57 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.91 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2254  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.19 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  34.33 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.52 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  34.33 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  34.33 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.51 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  33.57 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  33.66 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.67 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.09 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>