More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2038 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  100 
 
 
197 aa  409  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.84 
 
 
243 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  33.54 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  41.35 
 
 
212 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  30.73 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
196 aa  84.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  34.04 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  27.84 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3294  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.216078  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3396  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  32.86 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
277 aa  68.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.78 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  38 
 
 
783 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  29.1 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  35.35 
 
 
541 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  37.23 
 
 
236 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
259 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  38.24 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  36.17 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  32.46 
 
 
235 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3997  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 
204 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
293 aa  61.6  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  36.17 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  36.17 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  25.68 
 
 
229 aa  61.6  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31.2 
 
 
306 aa  61.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  36.17 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  36.17 
 
 
222 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.89 
 
 
266 aa  61.2  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
306 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  36.17 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  36.17 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.86 
 
 
457 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.2 
 
 
259 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.23 
 
 
280 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  34.34 
 
 
541 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  34.34 
 
 
541 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  34.34 
 
 
541 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  34.34 
 
 
541 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5451  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  31.67 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  24.48 
 
 
249 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  31.63 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  36.17 
 
 
236 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  28.46 
 
 
280 aa  58.5  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  24.18 
 
 
205 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1461  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.25 
 
 
291 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
240 aa  58.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12690  hypothetical protein  33.66 
 
 
250 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.09325e-49  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
266 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 
216 aa  57.8  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
232 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.86 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
242 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  29.11 
 
 
304 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.63 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.5 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  30 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.22 
 
 
330 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
328 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.39 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.33 
 
 
283 aa  56.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
247 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  26.17 
 
 
241 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.33 
 
 
310 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  30.15 
 
 
233 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.73 
 
 
434 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  36.28 
 
 
255 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
255 aa  55.5  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>