115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4843 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  58.62 
 
 
205 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  59.41 
 
 
204 aa  243  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  55.61 
 
 
223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  51.72 
 
 
206 aa  221  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  50.26 
 
 
203 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  50.26 
 
 
203 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  48.76 
 
 
209 aa  205  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  50.73 
 
 
294 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  54.12 
 
 
204 aa  201  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  48.98 
 
 
205 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  46.46 
 
 
205 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  37.19 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  44.9 
 
 
207 aa  171  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  46.46 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  42.5 
 
 
207 aa  165  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  43.84 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  47.87 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  46.56 
 
 
194 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  24.18 
 
 
197 aa  58.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  35.58 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  28.66 
 
 
241 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  31.48 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.14 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
239 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  30 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.86 
 
 
420 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  21.49 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  29.93 
 
 
198 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  20.78 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  25.93 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2590  hypothetical protein  20.78 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
309 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2333  methyltransferase  21.43 
 
 
209 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0767046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
305 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  30.56 
 
 
225 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  30.89 
 
 
235 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2645  hypothetical protein  21.31 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  20 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.95 
 
 
329 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12690  hypothetical protein  33.64 
 
 
250 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.09325e-49  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
335 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 
273 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  25.76 
 
 
242 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  24.18 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  28.36 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
267 aa  45.1  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  27.18 
 
 
312 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
214 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
306 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
238 aa  44.7  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.57 
 
 
241 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.36 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
283 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2368  methyltransferase  21.43 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941148  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  26.03 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  29.21 
 
 
286 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3299  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.33 
 
 
280 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.17 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  21.77 
 
 
524 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.33 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  25 
 
 
228 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
320 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1367  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000820801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
349 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
281 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  33.91 
 
 
304 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.43 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
260 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 
276 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  31.36 
 
 
411 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  22.9 
 
 
307 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  34 
 
 
253 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
234 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2762  hypothetical protein  17.95 
 
 
209 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  25 
 
 
214 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>