71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1362 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  100 
 
 		 206 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  62.56 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  59.61 
 
 		 205 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  56.93 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  52.26 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  51.72 
 
 		 205 aa  221  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  49.02 
 
 		 209 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  51.74 
 
 		 204 aa  215  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  48.97 
 
 		 203 aa  208  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  48.97 
 
 		 203 aa  208  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  49.01 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  47.78 
 
 		 206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  46.53 
 
 		 205 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  45.5 
 
 		 205 aa  187  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  44.66 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  39.5 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  41.06 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  46.97 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  48.13 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.35 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  28.27 
 
 		 339 aa  51.6  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  30.09 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  25.18 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  28.09 
 
 		 338 aa  48.5  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  23.73 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  31.85 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  29.55 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  24.74 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  24.16 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  29.61 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.83 
 
 		 282 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  26.7 
 
 		 339 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.63 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.84 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.2 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  27.37 
 
 		 339 aa  45.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 382 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  26.27 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.79 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.87 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubiE  25.22 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1762  demethylmenaquinone methyltransferase  21.91 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  21.43 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.66 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2118  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.22 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660073  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 283 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 261 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.48 
 
 		 267 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.11 
 
 		 277 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 195 aa  42  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04841  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  22.3 
 
 		 232 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 250 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  25.41 
 
 		 201 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 237 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  25.7 
 
 		 339 aa  41.6  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  24.21 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>