160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2512 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  100 
 
 
339 aa  701    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  83.78 
 
 
339 aa  606  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  71.98 
 
 
339 aa  523  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  70.8 
 
 
339 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  70.33 
 
 
339 aa  509  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  70.92 
 
 
339 aa  509  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  69.91 
 
 
339 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  69.14 
 
 
338 aa  501  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  45.56 
 
 
354 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  28.81 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  28.39 
 
 
373 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  29.95 
 
 
630 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  29.95 
 
 
630 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  24.92 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  27.54 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  24.26 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  26.32 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  27.24 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  25.86 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  21.82 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  21.99 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  23.57 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  24.82 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  23.79 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  21.82 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  23.87 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  21.82 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  21.82 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  21.82 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  23.61 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  26.59 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  27.17 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  21.52 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  21.52 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  21.52 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  23.69 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  21.84 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.3 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  27.06 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  24.3 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  24.26 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  28.75 
 
 
334 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.68 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  24.63 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  23.33 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  24.4 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  23.91 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  25.16 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2124  O-methyltransferase family protein  21.26 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  23.79 
 
 
364 aa  62.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  21.05 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  28.69 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  26.79 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  21.86 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  21.05 
 
 
473 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  21.05 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  26.05 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  25.22 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  23.62 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  21.3 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  24.03 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  21.05 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  24.17 
 
 
375 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  23.81 
 
 
353 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  21.05 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  21.05 
 
 
367 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  24.05 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  23.24 
 
 
379 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  24.21 
 
 
346 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  23.23 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4167  O-methyltransferase family protein  32.61 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116643  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  24.78 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  23.31 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  24.16 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  22.53 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  23.08 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  23.31 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  24.76 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.17 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  23.31 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.66 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  25.93 
 
 
345 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  24.9 
 
 
355 aa  57  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  24.69 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  26.74 
 
 
337 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  27.61 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  24.52 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  21.7 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  20.49 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  29.36 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.72 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  22.18 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  24.58 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5675  Methyltransferase type 12  26.6 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196275  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  23.87 
 
 
352 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  24.53 
 
 
352 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  26.11 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1495  hypothetical protein  24.38 
 
 
382 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.114106  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 
392 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  29.09 
 
 
411 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>