65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0971 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  100 
 
 
210 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  46.63 
 
 
204 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  45.59 
 
 
204 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  41.06 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  43.54 
 
 
205 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  45.1 
 
 
223 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 
205 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  35.75 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  41.06 
 
 
206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  43.84 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  40 
 
 
207 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  39.9 
 
 
209 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  40.59 
 
 
203 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  40.59 
 
 
203 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  44.22 
 
 
294 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  37.68 
 
 
207 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  39.13 
 
 
206 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  43.16 
 
 
209 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  39.71 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  38.69 
 
 
194 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  34.64 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
240 aa  55.1  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  35.62 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2280  methyltransferase type 12  29.66 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  33.04 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
243 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.63 
 
 
237 aa  48.5  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  33.06 
 
 
312 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.17 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  29.63 
 
 
283 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  33.9 
 
 
198 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  32.91 
 
 
226 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
262 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  33.9 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  32.77 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  30.63 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  35.34 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  27.69 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  24.5 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  35.37 
 
 
307 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
253 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  27.49 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  38.1 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.3 
 
 
234 aa  42  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  32.92 
 
 
208 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  35.09 
 
 
233 aa  42  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  26.97 
 
 
177 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
210 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
210 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
197 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
248 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
248 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  32.14 
 
 
213 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>