34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0485 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  100 
 
 		 209 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  58.64 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  57.84 
 
 		 207 aa  225  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  59.16 
 
 		 194 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  52.82 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  56.76 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  58.64 
 
 		 206 aa  201  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  51.79 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  48.13 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  48.17 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  47.87 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  50.8 
 
 		 205 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  52.46 
 
 		 294 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  41.08 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  46.52 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  46.52 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  48.66 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  43.01 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  45.6 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  43.16 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  31.65 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 260 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.48 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  28.29 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  35.85 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3102  methyltransferase type 11  22.16 
 
 		 292 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  32 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  21.97 
 
 		 236 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  20.55 
 
 		 236 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  21.97 
 
 		 236 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  35.09 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  22.5 
 
 		 290 aa  41.6  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>