27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6933 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  51.01 
 
 
206 aa  222  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  48.51 
 
 
204 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  45.15 
 
 
205 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  46 
 
 
294 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  44.66 
 
 
206 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  45.05 
 
 
206 aa  181  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  43.84 
 
 
205 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  44.16 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  42.72 
 
 
205 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  47.03 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  43.35 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  44.22 
 
 
209 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  42.5 
 
 
205 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  46.91 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  40.5 
 
 
203 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  40.5 
 
 
203 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  37.68 
 
 
210 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  39.71 
 
 
204 aa  148  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  43.01 
 
 
209 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  26.56 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  30.86 
 
 
243 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5314  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0284  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0256  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1601  hypothetical protein  28.57 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  37.66 
 
 
200 aa  41.6  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>