54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4066 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  60 
 
 		 205 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  52.26 
 
 		 206 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  53.99 
 
 		 223 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  55.22 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  56.63 
 
 		 204 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  51.02 
 
 		 203 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  51.02 
 
 		 203 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  50.73 
 
 		 205 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  52.53 
 
 		 204 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  53.57 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  52.26 
 
 		 205 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  50.51 
 
 		 207 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  49.5 
 
 		 205 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  46 
 
 		 207 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  40.91 
 
 		 206 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  50.51 
 
 		 206 aa  175  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  52.46 
 
 		 209 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  44.22 
 
 		 210 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0994  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.430888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  28.46 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  24.39 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  31.48 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  33.94 
 
 		 228 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  37.3 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36.11 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 195 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  35.53 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.97 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  23.97 
 
 		 213 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 233 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0872  methyltransferase type 12  24.56 
 
 		 206 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00554243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 277 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31.48 
 
 		 239 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>