More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5288 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 275 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  51.82 
 
 		 274 aa  294  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1675  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  hitchhiker  0.00263089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3299  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.23 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4585  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1810  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4205  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  29.96 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1505  methyltransferase type 11  34.76 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194787  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01744  hypothetical protein  36.13 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.1 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  32.24 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  36.5 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  36.75 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  41.74 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.71 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  21.19 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.19 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  21.19 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  34.29 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  35.45 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 197 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 182 aa  53.1  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  29.92 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  32.74 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 225 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.08 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 242 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  36.45 
 
 		 239 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 218 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 205 aa  52.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  30.18 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  35.48 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  29.01 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.05 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  33.88 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  25.34 
 
 		 575 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.5 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  35.92 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  35.92 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.37 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  31.43 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.91 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  25.32 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  32 
 
 		 205 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 319 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 397 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>