More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1675 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1675  Methyltransferase type 11  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  hitchhiker  0.00263089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
275 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3299  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.1 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4585  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
273 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1810  Methyltransferase type 11  37.87 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4205  methyltransferase type 11  38.07 
 
 
301 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  29.89 
 
 
267 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01744  hypothetical protein  28.99 
 
 
265 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1505  methyltransferase type 11  36.6 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194787  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.07 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  37.1 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  48.51 
 
 
457 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
248 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  33.83 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  32.35 
 
 
663 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
637 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.63 
 
 
256 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.53 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.78 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
348 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  40 
 
 
218 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
219 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.37 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
312 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  38 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  40.54 
 
 
429 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.56 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  34.46 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.82 
 
 
207 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.28 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.74 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  33.98 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
235 aa  56.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  36.89 
 
 
783 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.74 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.46 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  34.17 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.74 
 
 
256 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.65 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 
259 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  29.41 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.07 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.86 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
227 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 
253 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  31.58 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  34.58 
 
 
331 aa  53.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.12 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.54 
 
 
247 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  38.68 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  34.29 
 
 
234 aa  52.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.82 
 
 
258 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.82 
 
 
258 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
225 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.82 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  27.89 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  29.82 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  29.82 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  32.29 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
310 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
207 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  32.74 
 
 
322 aa  52.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.56 
 
 
233 aa  52.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  34 
 
 
248 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.82 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.73 
 
 
249 aa  52.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  35.85 
 
 
262 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
271 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
268 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 
222 aa  52.4  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
268 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
244 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
214 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
244 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>