More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1959 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  40.98 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  29.54 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  26.69 
 
 		 237 aa  102  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  27.16 
 
 		 234 aa  98.6  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  26.91 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  34.69 
 
 		 276 aa  89.4  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 267 aa  88.6  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  28.89 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  23.4 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  25.6 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  31.31 
 
 		 559 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  24.55 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.12 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  32.52 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 572 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  35.82 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  26.91 
 
 		 575 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  24.11 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  24.12 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  24.26 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  24.26 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  27.03 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  27.03 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  23.58 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  27.03 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  27.03 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  27.03 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  27.43 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  24.26 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  27.03 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  26.58 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  27.03 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  26.01 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  26.58 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  25.3 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 675 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  24.65 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1648  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.53805  normal  0.884834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  27.93 
 
 		 663 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  23.92 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.91 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  20.25 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  24.41 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  27.57 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  31.97 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  35.24 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  24.27 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6192  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  24.3 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  24.88 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  23.68 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  24.3 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  24.3 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 637 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  28.7 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  31.82 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  24.77 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.17 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  24.77 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  26.15 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  24.75 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 581 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  23.53 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.43 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  23.33 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.65 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  27.86 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>