219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0179 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  100 
 
 
272 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  79.32 
 
 
268 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  78.2 
 
 
268 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  69.55 
 
 
267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  68.3 
 
 
559 aa  390  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  70.19 
 
 
572 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  66.54 
 
 
269 aa  391  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  62.31 
 
 
283 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  47.19 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  49.79 
 
 
258 aa  232  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.99 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  25.6 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.7 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2485  hypothetical protein  30.52 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  34.55 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.24 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.24 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.24 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  25.79 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25.79 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  34.31 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  25.34 
 
 
249 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  30.7 
 
 
247 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  25.34 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  30.56 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  23.58 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  24.89 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6192  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
675 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  24.43 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  29.41 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  32.41 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  24.29 
 
 
249 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 
231 aa  59.7  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
248 aa  58.9  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
232 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  33.91 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  35.58 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1648  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
260 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.53805  normal  0.884834 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  30.73 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  34.62 
 
 
253 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  33.04 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  33.04 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  34.62 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  34.62 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  28.69 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.58 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  33.65 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
252 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  29.58 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  32.17 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.13 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
246 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
252 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1575  hypothetical protein  27.36 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00527276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0742  hypothetical protein  34.67 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  34.56 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  31.97 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 
200 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2289  hypothetical protein  30.63 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.811706  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  32.31 
 
 
221 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.43 
 
 
232 aa  49.7  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 
248 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  23.39 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
304 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
637 aa  49.3  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
225 aa  48.9  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
221 aa  48.9  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  25 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
457 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  23.73 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  33.7 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 
457 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  25 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  29.6 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  25.87 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  33.78 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  30.2 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0894  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.44 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000138444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>