More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0962 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  81.42 
 
 
262 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  54 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  47.37 
 
 
252 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  37.3 
 
 
262 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  35.57 
 
 
575 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  30.16 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  33.6 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  32.11 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  28.26 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  26.84 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  26.41 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  27.27 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  25.97 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  25.97 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  26.41 
 
 
254 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  25.97 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  25.97 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  26.84 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  24.41 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  24.41 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  24.41 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  28.06 
 
 
262 aa  81.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  24.02 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  24.02 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  27.4 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  27.16 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  24.41 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  27.53 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0127  methyltransferase type 12  29.15 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  32.3 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  24.02 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  26.64 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  26.36 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  26.53 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  23.72 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1366  hypothetical protein  29.69 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.229777  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  28.25 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.11 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  26.24 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  28.86 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  28.86 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  29.96 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.86 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  28.86 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  28.86 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.53 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  28.51 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  28.19 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  28.19 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  24.38 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  25.61 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  25.93 
 
 
416 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  33.09 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
637 aa  65.9  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  25.97 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.05 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  31.2 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  31.2 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  24.16 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  24.16 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  27.18 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  37.1 
 
 
268 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
280 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  26.98 
 
 
261 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  22.62 
 
 
266 aa  62.4  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  23.08 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
269 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  23.08 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  23.08 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  34.58 
 
 
663 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  23.08 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.91 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  23.08 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  23.87 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  26.53 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  22.78 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>