More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3970 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  40.71 
 
 
637 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  38.96 
 
 
663 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 
638 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
261 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  30.71 
 
 
259 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
252 aa  92  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  27.84 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  27.47 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 
675 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
304 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  27.31 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  24.73 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  24.07 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  26.36 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  23.11 
 
 
244 aa  62  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  26.16 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.87 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.51 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  32.92 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  25.52 
 
 
257 aa  59.3  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  27 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.97 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.31 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.45 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.58 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.55 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.19 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.55 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0781  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.45 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  28.11 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.9 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  24.51 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  35.85 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3549  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.78 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  25.91 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  22.71 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.61 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  24.77 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  25.38 
 
 
249 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25.38 
 
 
249 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1058  methyltransferase type 12  25.43 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  25.38 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  25.38 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  24.87 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  24.87 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.93 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  24.87 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.93 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  28.11 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.17 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  24.62 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  24.87 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  27.19 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  24.87 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  24.89 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.42 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.97 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  25.73 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  26.35 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  27.18 
 
 
246 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.37 
 
 
541 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.26 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  34.19 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2118  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  52  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.27 
 
 
243 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3368  2-polyprenylmethoxybenozoquinol methylase  32.77 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubiE  32.77 
 
 
250 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
256 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.93 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10568  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.17 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0587656  normal  0.225311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  26.9 
 
 
249 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0378  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.61 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  30.66 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
258 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  30.07 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  25 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.86 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.86 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>