More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1354 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  61.13 
 
 		 280 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  61.07 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  55.69 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  55.69 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  54.22 
 
 		 262 aa  278  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  51.75 
 
 		 259 aa  272  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  39.11 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 254 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  30.65 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  29.67 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  36.14 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 250 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  35.18 
 
 		 637 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  34.5 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 675 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  34.97 
 
 		 663 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  31.02 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  33.84 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  30 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  37.97 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  34.78 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  38.83 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  29.07 
 
 		 638 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  29.44 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  28.91 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  29.38 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  29.38 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  29.38 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  29.38 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  29.38 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  28.91 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  34.51 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  28.91 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  28.91 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  26.56 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  26.56 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  26.56 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  26.56 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  26.56 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  26.24 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  35.71 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.27 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  26.54 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  23.96 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  26.04 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  29.31 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  24.06 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  41.18 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  28.06 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  24.36 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.54 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  24.36 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  25.91 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  23.93 
 
 		 541 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  34.21 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  23.93 
 
 		 541 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  25.62 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  44.12 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  36.73 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  25.12 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  32.35 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  23.04 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>