More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1849 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 255 aa  531  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  47.56 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  43.67 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  45.61 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  43.93 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  35.89 
 
 		 262 aa  151  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  32.79 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  35.06 
 
 		 280 aa  141  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  32.39 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  28.23 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  31.42 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  31.12 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 		 675 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  31.67 
 
 		 663 aa  88.6  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  28.9 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  24.71 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 637 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.1 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.38 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  26.18 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  27.03 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  33.63 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  26.46 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  24.02 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  29.79 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.91 
 
 		 541 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.59 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  32.69 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.29 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  22.57 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.51 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  30.71 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  29.25 
 
 		 541 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_586  methyltransferase  22.49 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00349861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  29.25 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.37 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  29.25 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.85 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.85 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  25.24 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  28.3 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  35.83 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  22.49 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  22.49 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  32 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  34.55 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2097  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  26.02 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1058  methyltransferase type 12  21.74 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>