More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6455 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  100 
 
 		 316 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  72.2 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  59.09 
 
 		 274 aa  319  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  63.35 
 
 		 286 aa  318  9e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  60.15 
 
 		 269 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  60.73 
 
 		 284 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  58.04 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  57.71 
 
 		 276 aa  299  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  58.27 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  57.98 
 
 		 283 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  57.88 
 
 		 304 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  58.53 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  56.76 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  54.2 
 
 		 278 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  53.52 
 
 		 265 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  52.99 
 
 		 276 aa  271  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  54.2 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  56.32 
 
 		 277 aa  265  8.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  51.35 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  51.14 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  45.04 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  49.19 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 266 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  28.38 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.59 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.5 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  27.65 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  27.65 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.26 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 236 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  27.19 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  27.19 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  33.9 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  33.9 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  33.9 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  33.9 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  33.9 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  27.9 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  33.9 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  33.9 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  26.73 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  32.22 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  30.48 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  41.9 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  27.19 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  24.08 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  30.65 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  25.42 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  27.43 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  27.43 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  26.73 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  35.46 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  27.75 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.7 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  30.81 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  30.38 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  26.15 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  30.98 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  33.09 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  26.86 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  31.21 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  27.75 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  41.51 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  34.17 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.3 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  27.75 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  27.73 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  24.34 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  34.17 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  34.17 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  34.17 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  34.17 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  24.42 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>