More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0680 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_586  methyltransferase  92.14 
 
 
293 aa  530  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00349861  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0618  methyltransferase type 12  86.33 
 
 
280 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00582618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
277 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  35.06 
 
 
281 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  39.87 
 
 
541 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  39.87 
 
 
541 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  39.22 
 
 
541 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  39.22 
 
 
541 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  39.22 
 
 
541 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  26.55 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  26.99 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
226 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  25.79 
 
 
246 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.71 
 
 
232 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  35.58 
 
 
200 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.56 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
225 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  25.77 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
247 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.71 
 
 
232 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  26.38 
 
 
222 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  26.38 
 
 
236 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.51 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  23.47 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  29.82 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.89 
 
 
230 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.91 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  29.82 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  23.65 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  25.77 
 
 
236 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  25.77 
 
 
236 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 
234 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.52 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  24.07 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  28.95 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  33.85 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  22.49 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  39.19 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  21.79 
 
 
675 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.74 
 
 
229 aa  57  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  24.51 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 
232 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  25.35 
 
 
253 aa  56.6  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.86 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 
232 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 
232 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  30.3 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  33.96 
 
 
211 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  24.87 
 
 
252 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 
232 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
232 aa  55.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.61 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  29.01 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.79 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.71 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  29.91 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0895  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0858242  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.65 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  29.7 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  28.18 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  25.73 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  25.46 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.49 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.97 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  25.11 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  25.11 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.49 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  23.89 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.45 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.19 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  25.11 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
210 aa  53.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.9 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.34 
 
 
253 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.9 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25.11 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>