More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0248 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  519  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  45.56 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  45.27 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  43.44 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  42.8 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  43.15 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  45.16 
 
 		 261 aa  214  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  42.74 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  44.35 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  43.95 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  41.53 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  42.51 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  43.95 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  43.55 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  40.3 
 
 		 263 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  39.3 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  39.3 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  39.85 
 
 		 261 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  39.85 
 
 		 261 aa  197  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 285 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  39.54 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  25.86 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  25.86 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.8 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.8 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.8 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25.94 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.8 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.94 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.8 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  23.57 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  25.19 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  29.26 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  31.43 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  35.56 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  22.67 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  25.39 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  27.07 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  25.13 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  25.11 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  24.77 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  26.4 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  33.58 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  22.88 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  33.58 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  31.13 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  25.68 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  28.15 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  23.53 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  23.02 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.01 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  24 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  26.62 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  27.22 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  23.04 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.27 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.86 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  22.94 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  29.08 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.26 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  23.67 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  25.42 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  25.74 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  21.7 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  36.73 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  25 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 152 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.56 
 
 		 201 aa  52.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 		 234 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 277 aa  52  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>