More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0592 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  100 
 
 		 221 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  32.05 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  26.94 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  28.09 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.38 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  36.61 
 
 		 638 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0487  methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0843  methyltransferase type 11  25 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.783173  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.43 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.53 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 675 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.43 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.43 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 305 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.26 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  30.41 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3294  6-O-methylguanine DNA methyltransferase  25.76 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000239587 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.48 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.46 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  28.77 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  30.3 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  28.77 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3118  methyltransferase type 11  24.63 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2974  methyltransferase type 11  24.63 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  25.33 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.98 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  29.58 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  33.04 
 
 		 783 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  32.48 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  32.43 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.68 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1437  methyltransferase type 11  25 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00131296  decreased coverage  0.0000500722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  29.2 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.66 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.66 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  32.5 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  29.79 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  53.33 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1554  hypothetical protein  25.39 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  31.48 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2368  methyltransferase  24.71 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.97 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.58 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.71 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  28.9 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  26.14 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  39.19 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.91 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  34.29 
 
 		 663 aa  55.1  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  26.43 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  27.71 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>