193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3294 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3294  6-O-methylguanine DNA methyltransferase  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000239587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  49.76 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0114  Methyltransferase type 11  46.63 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0267  Methyltransferase type 11  43.81 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.992817  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10331  hypothetical protein  48.28 
 
 		 151 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2368  methyltransferase  27.23 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  26.7 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2333  methyltransferase  26.7 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0767046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  25.58 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2590  hypothetical protein  25.58 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2762  hypothetical protein  26.7 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2645  hypothetical protein  26.7 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2608  hypothetical protein  26.18 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  27.17 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  25.99 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  25.12 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  25.99 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  25.99 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  25.99 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  25.99 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  29.19 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  25.99 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3102  methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  28.74 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  28.65 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  37.27 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6235  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2950  methyltransferase type 11  26.07 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.429444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  26.9 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0944  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  37.39 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  37.61 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.45 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.45 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  27.98 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10330  hypothetical protein  35.38 
 
 		 74 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0391  methyltransferase domain-containing protein  34.21 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  24.59 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  35.45 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.54 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  24.22 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  26.37 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  31.43 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  26.37 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  33.62 
 
 		 387 aa  48.5  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  32.73 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13560  Tellurite resistance protein TehB  39.29 
 
 		 117 aa  48.5  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  30.09 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  31.19 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  26.28 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  27.56 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  25.82 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  26.28 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  27.18 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  24.81 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  26.28 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  24.81 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  25.82 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.85 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  22.35 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  25.5 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1810  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  24.24 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 272 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  28.75 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  27.1 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  28.49 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  23.75 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.17 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  24.72 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.11 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>