261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1939 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  76.35 
 
 
204 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  75.49 
 
 
217 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  75.86 
 
 
204 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  52.74 
 
 
201 aa  207  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  48.54 
 
 
209 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  48.99 
 
 
207 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  46.31 
 
 
211 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  46.19 
 
 
198 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  47.18 
 
 
213 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  47.18 
 
 
213 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  45.13 
 
 
212 aa  168  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  42.13 
 
 
221 aa  162  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  43.37 
 
 
200 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 
200 aa  148  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  45.22 
 
 
167 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  39.6 
 
 
201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  39.6 
 
 
201 aa  134  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
195 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  39.49 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  38.07 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  36.32 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  34 
 
 
198 aa  121  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  34.52 
 
 
204 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  34.18 
 
 
197 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  30.39 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  30.39 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  29.95 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  29.41 
 
 
200 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  29.41 
 
 
200 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  30.7 
 
 
217 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  32.08 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  39.33 
 
 
149 aa  92  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  34.78 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  29.8 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
197 aa  85.1  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  31.82 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  35.25 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  34.06 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  34.33 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  35.06 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  33.73 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35.82 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  25.38 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  32.37 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  37.24 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  34.59 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  32.88 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  31.22 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  35.15 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
243 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  29.81 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
290 aa  61.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
253 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  34.55 
 
 
272 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  46.67 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  34.55 
 
 
272 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  33.64 
 
 
272 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
215 aa  58.9  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  36.36 
 
 
272 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  30 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  33.64 
 
 
272 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  30.05 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  32.22 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  32.61 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  32.67 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  30.88 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  35.8 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  32.73 
 
 
272 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  25.84 
 
 
236 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  31.45 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  32.73 
 
 
272 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  32.73 
 
 
275 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  32.73 
 
 
272 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  31.41 
 
 
180 aa  55.1  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  32.11 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  28.89 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30.47 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  38.89 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  28.12 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  32.65 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  28.12 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  27.53 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  26.58 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  28.12 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  32.14 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.134016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>