206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1191 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  81.37 
 
 		 217 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  81.37 
 
 		 204 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  76.35 
 
 		 208 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  53.81 
 
 		 201 aa  207  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  49.51 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  51.81 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  48.24 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  44.16 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  47.45 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 213 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  44.44 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  40.1 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  44.3 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  40.1 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  39.59 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  39.29 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  38.58 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  37.56 
 
 		 199 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  38.34 
 
 		 195 aa  130  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  37.19 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  37.24 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  36.97 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  32.47 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  32.47 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  32.47 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  32.29 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  34.48 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  31.28 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  40.65 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  30 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  34.76 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  32.93 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  30.48 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  35.82 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  36.09 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.03 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  34.59 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  36.31 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.58 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  31.71 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  31.06 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  30.36 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  25.69 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  30.56 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  32.14 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  32.12 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  32.97 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  28.57 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  38.61 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  34.85 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  32.73 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  32.73 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  28.57 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  32.12 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  28.71 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  31.82 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  30.16 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  29.08 
 
 		 410 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  28.71 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  28.71 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  28.71 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  33.13 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  29.81 
 
 		 292 aa  52  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  29.2 
 
 		 272 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  32.53 
 
 		 243 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  30.91 
 
 		 272 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  30.63 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  33.77 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  28.74 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>