More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0746 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 254 aa  528  1e-149  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  91.73 
 
 		 254 aa  488  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  71.71 
 
 		 258 aa  387  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  43.53 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  42.53 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  42.15 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  42.15 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  41.76 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  41.76 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  41 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2801  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  40.23 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  34.35 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  34.35 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  31.92 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1452  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  30.22 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  24.47 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0330  hypothetical protein  48.72 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.84 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.86 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  24.86 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.06 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  25.54 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  23.74 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  34.17 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  31.93 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.91 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.25 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  34.68 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  29.46 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  33.94 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  28.88 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.72 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.89 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.25 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.36 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  30.63 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.36 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  28.4 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.84 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.84 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.52 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  25.21 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.36 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.38 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  34.62 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.78 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  29.84 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.83 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  24.36 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.91 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.55 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.91 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.91 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.91 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.48 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>