108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0267 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0267  Methyltransferase type 11  100 
 
 
220 aa  442  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.992817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  54.38 
 
 
220 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3294  6-O-methylguanine DNA methyltransferase  43.81 
 
 
223 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000239587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0114  Methyltransferase type 11  41.59 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10331  hypothetical protein  54.36 
 
 
151 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3102  methyltransferase type 11  23.2 
 
 
292 aa  78.2  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2608  hypothetical protein  24.35 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2368  methyltransferase  24.37 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2645  hypothetical protein  23.04 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6235  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  23.56 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10330  hypothetical protein  56.9 
 
 
74 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  23.56 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  23.56 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2333  methyltransferase  23.04 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0767046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2590  hypothetical protein  23.56 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2762  hypothetical protein  21.24 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2950  methyltransferase type 11  22.16 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.429444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4081  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 
211 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359937  normal  0.129541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  24.73 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  26.4 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0944  Methyltransferase type 11  21.83 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  25.45 
 
 
221 aa  51.6  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.46 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  31.71 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.76 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.05 
 
 
289 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  26 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  28.79 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 
274 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
277 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  43.04 
 
 
396 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  26.49 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  24.82 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  24.67 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  22.67 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  22.67 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  26.01 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
266 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  24.11 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.26 
 
 
255 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  35.4 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
257 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  29.17 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 
194 aa  45.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  21.95 
 
 
235 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
310 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
269 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.26 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.57 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  28.09 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  27.22 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  29.13 
 
 
395 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.25 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  26.79 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.91 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  31.78 
 
 
387 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  30.92 
 
 
277 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  23.33 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
252 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.88 
 
 
254 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  34.92 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
269 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  21.93 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.89 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  31.19 
 
 
253 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.33 
 
 
258 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
276 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
273 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  35 
 
 
251 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
256 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>