More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5523 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  100 
 
 
276 aa  553  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  68.98 
 
 
282 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  69.58 
 
 
286 aa  360  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  66.01 
 
 
283 aa  342  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  62.16 
 
 
269 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  61.39 
 
 
274 aa  321  9.000000000000001e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  61.3 
 
 
284 aa  320  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  63.24 
 
 
268 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  57.8 
 
 
304 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  59.61 
 
 
362 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  57.14 
 
 
262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  57.2 
 
 
265 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  57.71 
 
 
316 aa  299  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  57.71 
 
 
278 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  56.27 
 
 
276 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  55.64 
 
 
274 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  56.76 
 
 
266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  55.89 
 
 
293 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  53.28 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  59.04 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  54.83 
 
 
299 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  51.16 
 
 
300 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  37.9 
 
 
256 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  34.1 
 
 
266 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  35.5 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.92 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  24 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  48.51 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  33.9 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  33.9 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  33.9 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  33.9 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.88 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  33.9 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  33.9 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  33.9 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.99 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  30.81 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  30.99 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  30.99 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  26.37 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  30.81 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  24.47 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  30.99 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  29.67 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  31.61 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  30.41 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.52 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  31.44 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  43.64 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  22.76 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.76 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.91 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  35.25 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  29.41 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.71 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  33 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  33 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  33 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.42 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  36.79 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  23.01 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  39.5 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  23.01 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  39.82 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  26.57 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
244 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  43.27 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  22.77 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  22.04 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  23.01 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>