More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2880 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  61.62 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  48.38 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  42.5 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  42.16 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  41.35 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  42.16 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  42.16 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  42.16 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  43.43 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  43.43 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.65 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  33.33 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.34 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.79 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.07 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  31.75 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.41 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  35.04 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  36.28 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  39.47 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.73 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  36 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.75 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  40 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  36.52 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  24.64 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 634 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 187 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  42.06 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.93 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3277  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  41.96 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.15 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.34 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.26 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0958  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.85 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36.59 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  30 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  36.19 
 
 		 387 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.16 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  25.18 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  25.12 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.74 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.38 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.96 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.36 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.58 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.38 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>