More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0218 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  98.41 
 
 
252 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  76.38 
 
 
255 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  76.38 
 
 
255 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  72.05 
 
 
254 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  64.44 
 
 
257 aa  291  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  60.33 
 
 
252 aa  278  8e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  55.33 
 
 
255 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  53.85 
 
 
249 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  51.6 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  51.22 
 
 
252 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  51.87 
 
 
331 aa  217  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  50.62 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  52.85 
 
 
246 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  51.64 
 
 
246 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  40 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  45.54 
 
 
457 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
293 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.37 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  43.56 
 
 
222 aa  62  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  38 
 
 
235 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  39 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
241 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  33 
 
 
285 aa  58.9  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.41 
 
 
279 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
272 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  31.9 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  40.45 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0958  Methyltransferase type 11  36.57 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  41.76 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 
310 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
328 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.62 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20830  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.48 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  37.59 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
710 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.14 
 
 
229 aa  55.8  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
283 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
328 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  37.11 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.54 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  29.2 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
711 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  44 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  36.57 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  36 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  36.11 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.86 
 
 
345 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.84 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  33.62 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
194 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.13 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  31.54 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  38.95 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.61 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  35.86 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  35.86 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  37 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  35.86 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  41.76 
 
 
196 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  32.98 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
257 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.9 
 
 
263 aa  52.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
409 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  35.48 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>