237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0401 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  100 
 
 
257 aa  520  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  64.68 
 
 
252 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  64.29 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  64.29 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  64.71 
 
 
252 aa  298  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  64.71 
 
 
255 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  62.3 
 
 
254 aa  294  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  62.75 
 
 
255 aa  291  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  54.77 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  52.65 
 
 
249 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  51.45 
 
 
245 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  52.08 
 
 
252 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  50.84 
 
 
331 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  50 
 
 
245 aa  215  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  50.81 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  52.7 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  35.62 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
457 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  38.98 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  25 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
240 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
283 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
256 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0958  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  38.54 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.46 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.35 
 
 
258 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.27 
 
 
245 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.8 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  41 
 
 
253 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
237 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  35.29 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
1106 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.82 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.68 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  33.66 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.68 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.91 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  32.04 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  40 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  31.07 
 
 
235 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  32.73 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  30 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
232 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  34.02 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.64 
 
 
233 aa  49.3  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  24.06 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.65 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  38.54 
 
 
272 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  34 
 
 
242 aa  48.9  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  42.42 
 
 
263 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
244 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  23.66 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  38.54 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  35.05 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.63 
 
 
282 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  25.96 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  32.29 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.65 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.74 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  30.97 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.65 
 
 
279 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
409 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
233 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
241 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  34.34 
 
 
276 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  34 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.26 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>