More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1474 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  75.93 
 
 
245 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  73.25 
 
 
246 aa  344  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  71.78 
 
 
252 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  72.38 
 
 
249 aa  342  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  63.98 
 
 
331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  61.28 
 
 
245 aa  288  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  54.85 
 
 
252 aa  251  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  57.72 
 
 
246 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  56.91 
 
 
255 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  55.33 
 
 
252 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  55.33 
 
 
252 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  54.04 
 
 
257 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  54.92 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  52.44 
 
 
255 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  51.43 
 
 
254 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.77 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  35.96 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  42.57 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  38.14 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
223 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  32.12 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  38.14 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
246 aa  62  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.33 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.33 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.97 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  31.01 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  36.21 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.04 
 
 
272 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
310 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
202 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
264 aa  58.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
237 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  35.56 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.63 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.05 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.84 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.34 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  36.21 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0958  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.82 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1935  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  32.82 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.58 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  39.42 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  36.11 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  37.11 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.12 
 
 
252 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.96 
 
 
206 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
247 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0064  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 
223 aa  55.5  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.68 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  39.36 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  32.28 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  35.05 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.05 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  36.72 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.17 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  32.06 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
211 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  42.27 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.78 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  32.17 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>