189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0064 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0064  Methyltransferase type 11  100 
 
 
223 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0764  methyltransferase type 11  50 
 
 
199 aa  201  9e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.855881  decreased coverage  0.00371896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1860  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
203 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.762875 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1393  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
203 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0409  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0871  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
204 aa  92  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1314  methyltransferase type 11  34.64 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  24.77 
 
 
285 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  27.09 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6684  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00241192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  24.55 
 
 
221 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  27.95 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  25.36 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.19 
 
 
503 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.13 
 
 
255 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.54 
 
 
235 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  26.9 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.94 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  36.05 
 
 
275 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.06 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  32.52 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  31.52 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  31.52 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  23.89 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
634 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.23 
 
 
252 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.75 
 
 
233 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  32.65 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.73 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1780  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115692  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  26.9 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.87 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  27.56 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  26.04 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  25.71 
 
 
256 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.99 
 
 
268 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
264 aa  49.3  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  32.29 
 
 
265 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
299 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.71 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.31 
 
 
278 aa  48.5  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  31.68 
 
 
261 aa  48.5  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
300 aa  48.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.01 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.62 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  25.71 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
264 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.71 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  30.85 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0166  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.39 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
191 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  37.93 
 
 
312 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10568  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.07 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0587656  normal  0.225311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  30.53 
 
 
272 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  24.37 
 
 
284 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.14 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  29.2 
 
 
275 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  26.05 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1237  hypothetical protein  33.03 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2185  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.89 
 
 
238 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  26.67 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.87 
 
 
238 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1453  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.92 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00782533  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5258  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  27.68 
 
 
269 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  22.41 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
267 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
252 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.87 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0983  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.7 
 
 
228 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>