More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2928 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  44.08 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  42.23 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  39.9 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  43.2 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  42.51 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.63 
 
 		 503 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  42.58 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  39.71 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  39.77 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0256  methlytransferase  33.53 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272291  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1780  methyltransferase type 11  35.67 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115692  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0409  methyltransferase type 11  35.39 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  33.82 
 
 		 285 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0871  methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1393  methyltransferase type 11  38.04 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1860  methyltransferase type 11  35.33 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.762875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1031  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.67 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1314  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 267 aa  62  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  26.98 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.95 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0064  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  30.82 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.26 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  33.33 
 
 		 658 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  31.85 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 624 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 349 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0743  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.999893  normal  0.843892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  30.37 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.45 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 341 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.85 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 342 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.89 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  34.03 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  30.37 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0764  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.855881  decreased coverage  0.00371896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.49 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.22 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  30.41 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  27.36 
 
 		 629 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>