More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0846 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  100 
 
 
251 aa  489  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  35.75 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  38.86 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.38 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  33.49 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  31.78 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  32.93 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  22.48 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  46.88 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.66 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  32.86 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  31.4 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  46.32 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  31.4 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  31.4 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  31.4 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  31.4 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  31.4 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  24.02 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.67 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.26 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  32.29 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  43.81 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  32 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  31.27 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  39.39 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
266 aa  62.4  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
235 aa  62  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  25.27 
 
 
218 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.71 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.5 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0041  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.38 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.921804 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  34.03 
 
 
206 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.35 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  31.56 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.36 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  26.34 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  37.25 
 
 
353 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3549  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.73 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3368  2-polyprenylmethoxybenozoquinol methylase  34.43 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  24 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
353 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  27.43 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.05 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.96 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.29 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 
299 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  28.32 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  26.82 
 
 
245 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
269 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  46.08 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  43.62 
 
 
243 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.42 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  40.62 
 
 
233 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.27 
 
 
233 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  27.37 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
207 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
269 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.36 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.15 
 
 
278 aa  58.9  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.82 
 
 
255 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.38 
 
 
230 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
262 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.38 
 
 
230 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.83 
 
 
230 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.09 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  28.09 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2783  Methyltransferase type 11  42.39 
 
 
190 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
197 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.09 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  24.23 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  30.63 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
191 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>