More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1805 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  76.54 
 
 		 261 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  47.13 
 
 		 280 aa  265  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  41.15 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 269 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  40.52 
 
 		 241 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  40.52 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  31.54 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  31.54 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  31.54 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  30.21 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  31.54 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  31.54 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  31.54 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  31.54 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  29.36 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  27.09 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  29.36 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  29.36 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  29.36 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  29.36 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  29.62 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  25.1 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  33.67 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  32.68 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  38.31 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  38.31 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  38.31 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  29.07 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  29.07 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  24.11 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  27.71 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.9 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  22.62 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.61 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.44 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  33.17 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.66 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  37.84 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  29.45 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  29.45 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  29.45 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  31.44 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.98 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  28.77 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.77 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  28.77 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.44 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.32 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  24.28 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  28.08 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  26.69 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  31.44 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  31.44 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  31.44 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  28.64 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  32.66 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.69 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.06 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  40.62 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.45 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  44.34 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>