More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
278 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  67.94 
 
 
266 aa  349  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  70.8 
 
 
277 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  58.25 
 
 
304 aa  326  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  63.88 
 
 
274 aa  326  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  61.2 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  60.4 
 
 
265 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  58.11 
 
 
293 aa  298  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  54.75 
 
 
282 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  55.04 
 
 
269 aa  295  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  56.98 
 
 
274 aa  295  8e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  57.71 
 
 
276 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  54.75 
 
 
362 aa  292  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  58.87 
 
 
286 aa  291  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  57.75 
 
 
276 aa  291  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  55.11 
 
 
300 aa  291  8e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  57.36 
 
 
283 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  54.2 
 
 
316 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  56.86 
 
 
268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  59.84 
 
 
299 aa  268  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  55.33 
 
 
269 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  53.39 
 
 
284 aa  265  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  34.8 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  27.64 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  33.85 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  34.38 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  37.24 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
235 aa  72  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  30.06 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.02 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.89 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  31.69 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  28.73 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  28.96 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  28.96 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.46 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  29.28 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.84 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  28.95 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  28.96 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  40.77 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  36.47 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0781  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  41.96 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  28.42 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  31.76 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  34.57 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.86 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.77 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  30.14 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  34.74 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  45.63 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6684  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00241192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.86 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  33 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  38.14 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  33 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  33 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  33 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  22.99 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.81 
 
 
230 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.86 
 
 
230 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.86 
 
 
230 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0796  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.55 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  38.32 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  33 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  33 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  31 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.05 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3644  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.73 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.423854  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.55 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  40.59 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  41.24 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
250 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 
225 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  40.91 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41 
 
 
232 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25.43 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  41.44 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.07 
 
 
229 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.59 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>