More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3199 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  100 
 
 
284 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  61.3 
 
 
276 aa  320  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  61.96 
 
 
286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  61.04 
 
 
362 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  58.85 
 
 
282 aa  304  9.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  60.73 
 
 
316 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  58.08 
 
 
262 aa  299  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  56.06 
 
 
276 aa  295  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  58.53 
 
 
268 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  54.96 
 
 
265 aa  285  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  58 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  53.45 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  52.69 
 
 
304 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  55.56 
 
 
269 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  53.21 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  56.73 
 
 
274 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  57.69 
 
 
266 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  57.09 
 
 
299 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  53.39 
 
 
278 aa  265  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  50 
 
 
269 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  53.11 
 
 
277 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  45.39 
 
 
300 aa  226  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  33.92 
 
 
256 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  33.19 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  26.85 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.76 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  24.89 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  37.75 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  38.05 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.68 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  27.04 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.72 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  37.2 
 
 
239 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  24.81 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  38.92 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  24.81 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  30.3 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  24.81 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  31.85 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  32.81 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  32.81 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  32.81 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  32.81 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  32.81 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  32.81 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  27.19 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  33.85 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  24.42 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  24.42 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 
237 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.63 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42.74 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  23.48 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  31 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  38.86 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  28.51 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  33.33 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  36.53 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  29.28 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  29.08 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  38.34 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  29.08 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  38.34 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  29.32 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  27.99 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.98 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  27.68 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  33.54 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  49.07 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  31.03 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  25.94 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  25.56 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  31.03 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  30.51 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  31.84 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  25.94 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  34.71 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.18 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  41.8 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  37.57 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  26.69 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  30.93 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  25.56 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>