More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2949 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  100 
 
 
299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  54.75 
 
 
304 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  63.53 
 
 
266 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  54.18 
 
 
283 aa  280  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  56.75 
 
 
286 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  57.53 
 
 
262 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  55.84 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  57.09 
 
 
284 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  59.84 
 
 
278 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  54.83 
 
 
276 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  57.2 
 
 
269 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  54.89 
 
 
276 aa  266  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  55.51 
 
 
293 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  52.87 
 
 
282 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  51.22 
 
 
362 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  55.09 
 
 
265 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  59.04 
 
 
274 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  51.14 
 
 
316 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  51.57 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  52.65 
 
 
269 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  59.23 
 
 
277 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  48.78 
 
 
300 aa  238  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  36.24 
 
 
266 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
256 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.13 
 
 
233 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.7 
 
 
242 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  34.83 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  28.9 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  28.9 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.76 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
242 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  34.93 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.93 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  51.55 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  30.48 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  34.93 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  33.64 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  34.93 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  34.93 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.71 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  35.53 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  42.99 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.84 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  35.53 
 
 
241 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0781  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  44.12 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.71 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10568  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.4 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0587656  normal  0.225311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  43.14 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  50.52 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
238 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
236 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.33 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  39.04 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  43.75 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.24 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  27.62 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  43.75 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  36.73 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  40.98 
 
 
243 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  31.78 
 
 
238 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.21 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  26.37 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
373 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  42.2 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  43.75 
 
 
269 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  34.33 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  42.74 
 
 
411 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  22.61 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.79 
 
 
256 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  41.67 
 
 
231 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  44.21 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  42.99 
 
 
222 aa  63.5  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.12 
 
 
230 aa  63.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  43.12 
 
 
275 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.42 
 
 
230 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  45.36 
 
 
233 aa  63.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6684  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.44 
 
 
230 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00241192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  44.04 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  44.04 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
260 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0983  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  48.94 
 
 
228 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>