More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3370 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  87.12 
 
 
269 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  63.88 
 
 
286 aa  332  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  61.39 
 
 
276 aa  321  9.000000000000001e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  59.09 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  58.02 
 
 
362 aa  318  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  60.62 
 
 
282 aa  318  7e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  59.77 
 
 
268 aa  296  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  57.35 
 
 
304 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  56.98 
 
 
278 aa  295  8e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  56.15 
 
 
262 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  57.03 
 
 
283 aa  288  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  57.47 
 
 
266 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  54.98 
 
 
274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  53.79 
 
 
276 aa  277  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  59.68 
 
 
277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  53.21 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  52.52 
 
 
293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  54.23 
 
 
265 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  56.39 
 
 
299 aa  268  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  49.63 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  48.66 
 
 
300 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  34.84 
 
 
256 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  27.41 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.93 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  35.52 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.26 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.05 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.46 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.23 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.83 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  38.57 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  29.07 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.88 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  33.99 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  29.36 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.21 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.25 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  28.73 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  28.73 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  35.03 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.11 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.84 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  37.41 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  32.83 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  26.85 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  31.25 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  28.7 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.69 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  30 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  28.37 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  37.9 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  34.21 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.92 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  28.5 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  28.5 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  28.18 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  28.18 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  29.82 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  30.26 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  28.37 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  28.37 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  28.37 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  28.37 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  22.57 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  24.78 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  22.57 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  31.72 
 
 
292 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  28.24 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.44 
 
 
233 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.43 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>