157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0336 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  37.41 
 
 
269 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  39.43 
 
 
278 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  39.16 
 
 
276 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  36.43 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  36.43 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  36.43 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  38.24 
 
 
261 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  38.63 
 
 
268 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  37.27 
 
 
271 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  33.7 
 
 
266 aa  175  9e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  35.82 
 
 
267 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  36 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  35.56 
 
 
263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  41.5 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
257 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
279 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  37.4 
 
 
276 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  34.43 
 
 
267 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  37.36 
 
 
283 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  33.45 
 
 
255 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  34.56 
 
 
255 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  34.56 
 
 
255 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 
255 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
255 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  38.17 
 
 
294 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  34.56 
 
 
255 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  32 
 
 
264 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  32.37 
 
 
255 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  35.32 
 
 
255 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  32.73 
 
 
255 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  38.87 
 
 
294 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  34.02 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  34.02 
 
 
285 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  34.02 
 
 
285 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  33.92 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  36.09 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  32.84 
 
 
277 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  43.11 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  33.06 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  32.1 
 
 
283 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  28.15 
 
 
268 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  31.28 
 
 
266 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  37.58 
 
 
309 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  33.77 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  30.04 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  28.89 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  24.64 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  24.88 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.69 
 
 
278 aa  59.7  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
316 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.11 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  26.89 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  25.52 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  24.34 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  25.25 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  26.84 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  23.35 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  44 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  23.35 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  44 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  23.35 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  23.35 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
264 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  44 
 
 
253 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
268 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  42.67 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  44 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  43.42 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  27.98 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  27.36 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  27.36 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  30.9 
 
 
277 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  26.82 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  43.06 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.78 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  28.82 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  41.89 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  24.69 
 
 
236 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  25.26 
 
 
257 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  28.45 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>