187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0150 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 263 aa  547  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  57.47 
 
 		 255 aa  314  8e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  57.47 
 
 		 255 aa  314  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  57.09 
 
 		 255 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  56.7 
 
 		 255 aa  311  9e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  57.09 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  57.09 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  56.7 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  55.94 
 
 		 255 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  55.94 
 
 		 255 aa  298  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  52.99 
 
 		 267 aa  292  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  51.13 
 
 		 264 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  50.55 
 
 		 267 aa  278  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  48.7 
 
 		 264 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  48.68 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  49.43 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  49.06 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  45.56 
 
 		 268 aa  218  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  41.97 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  43.27 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  42.44 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  37.72 
 
 		 279 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  37.09 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  35.56 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  34.18 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  35.38 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  36.73 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  34.41 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  34.05 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  34.05 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  37.37 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  35.31 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  37.71 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  34.89 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  32.65 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  34.14 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  33.79 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  31.29 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  25.65 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  26.54 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25.65 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  25.39 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25.65 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  25.28 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  25.28 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.28 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.82 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  37.29 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  29.17 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  42.65 
 
 		 159 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  28.37 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  27.44 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  26.98 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  27.44 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  28.37 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  26.98 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  27.91 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  27.75 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  26.98 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  27.91 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27.23 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0029  methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  29.79 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  29.79 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  26.2 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.22 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.8 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1864  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.32 
 
 		 153 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.804482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  28 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.03 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  23.11 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  24.67 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3179  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0194529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>