132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2116 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  39.3 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  41.73 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  40 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  39.43 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  39.64 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  37.72 
 
 		 263 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  37.18 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  39.86 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  37.92 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  42.36 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  35.53 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  33.81 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  33.45 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  34.8 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  33.7 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  32.75 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  34.56 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  30.22 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  36.23 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  36.09 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  33.57 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  33.2 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  33.61 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  35.66 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  35.25 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  31.47 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 281 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  29.11 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  25.73 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  25.44 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  24.2 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  23.91 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  23.91 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  24.65 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  28.23 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  29.32 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  24.67 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  25.39 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  25.39 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  24.78 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  23.74 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  24.23 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  24.86 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  27.27 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  23.56 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  27.4 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  27.4 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  37.21 
 
 		 159 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.6 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  36.45 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1971  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000321939  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2060  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000109149  unclonable  0.0000217963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00158805  hitchhiker  0.0000000749006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  28.12 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  24.09 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  31.93 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  23.38 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>