190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0151 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 255 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  95.67 
 
 		 255 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  94.49 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  94.49 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  92.52 
 
 		 255 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  91.73 
 
 		 255 aa  483  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  92.13 
 
 		 255 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  92.13 
 
 		 255 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  91.34 
 
 		 255 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  63.02 
 
 		 267 aa  338  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  63.46 
 
 		 264 aa  338  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  60.46 
 
 		 264 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  57.25 
 
 		 267 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  55.94 
 
 		 263 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  56.47 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  53.73 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  47.69 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  44.7 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  42.05 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  38.87 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  42.16 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  36.47 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  36.43 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  35.54 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  34.56 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  35.32 
 
 		 280 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  32.71 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  35.32 
 
 		 283 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  31.99 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  31.79 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  35.69 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  34.8 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  35.69 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  35.87 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 285 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 285 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  32.97 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  32.51 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  27.45 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  45.24 
 
 		 159 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 269 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  25.84 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  25.73 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  29.67 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  29.19 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  29.19 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  25.22 
 
 		 284 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  30.57 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  30.57 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.09 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.09 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  28.91 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  27.75 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  28.91 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  27.44 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  27.96 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.67 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  25 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  27.01 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.67 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  26.54 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  26.3 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  26.3 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  25.94 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.59 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  24.63 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  23.87 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  25 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  25.64 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  26.32 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.81 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.12 
 
 		 249 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1864  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.17 
 
 		 153 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.804482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  22.4 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0316  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 96 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 195 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>