More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2006 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  54.41 
 
 		 266 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  44.58 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  33.87 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  32.85 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  30.45 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  33.09 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  32.36 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  34.1 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  31.12 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  28.15 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  30.95 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  28.7 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  29.8 
 
 		 281 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  28.51 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  28.51 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  28.63 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  28.11 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  35.11 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  28.11 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  31.2 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  29.18 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  28.11 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  28.06 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  27.45 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  30.4 
 
 		 283 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  30.04 
 
 		 276 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  32.78 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  31.72 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  25.78 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  28.74 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  25.39 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  25.73 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  24.72 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  27.99 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  26.91 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  29.77 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  25.59 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  29.77 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  24.18 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  27.78 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  24.18 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  26.52 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  26.29 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  25.5 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.06 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  27.22 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  25.97 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27.87 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  26.75 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  23 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  24.64 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  27.93 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.49 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  27.48 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  27.48 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  27.48 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  27.48 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  27.48 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.49 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  27.48 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.64 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.97 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>