292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3108 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  100 
 
 		 257 aa  534  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  56.47 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  56.86 
 
 		 255 aa  298  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  54.02 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  56.08 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  56.47 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  55.29 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  55.29 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  55.29 
 
 		 255 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  51.7 
 
 		 264 aa  288  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  54.9 
 
 		 255 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  54.9 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  52.63 
 
 		 267 aa  284  8e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  53.23 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  47.84 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  49.43 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  45.42 
 
 		 266 aa  239  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  43.61 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  43.02 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  41.11 
 
 		 276 aa  184  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  38.49 
 
 		 276 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  38.35 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  32.34 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  33.7 
 
 		 279 aa  154  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  36.46 
 
 		 285 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  32.86 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  33.09 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  33.7 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  38.55 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  37.45 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  32.95 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  32.34 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  33.21 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  34.06 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  33.09 
 
 		 294 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  30.25 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  30.74 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  29.18 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  25.65 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  27.9 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  28.11 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  27.9 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  28.85 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  28.37 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  28.37 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  28.5 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  27.14 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  28.37 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  28.37 
 
 		 272 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  27.14 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  24.42 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.77 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.77 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.77 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.77 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.77 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.55 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  27.05 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  25.24 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.55 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.55 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2304  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.55 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  23.48 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.19 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  25.39 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.48 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2305  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.03 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.79 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  32.04 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.79 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.79 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  30.22 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  25.58 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.82 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00158805  hitchhiker  0.0000000749006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.82 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2060  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.82 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000109149  unclonable  0.0000217963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.23 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1971  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.82 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000321939  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.5 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.87 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.33 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.52 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  32.28 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.25 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>